インターカレーター法で測定しにくいターゲットに。プローブ法という選択肢

インターカレーター法でこんなお悩みはありませんか？

リアルタイムPCRのインターカレーター法による発現解析で、

「融解曲線に複数ピークが出る…」
「目的産物以外の影響が気になる…」
「類似配列を区別したい…」
「重要なターゲットだけ、より特異的に確認したい…」

そんなお悩みはありませんか？

インターカレーター法は、手軽でコストパフォーマンスに優れた検出法ですが^（注１）PCR反応液中の二本鎖DNAすべてを蛍光色素で検出する方法のため、目的産物以外の非特異的増幅産物やプライマーダイマーもシグナルとして検出され、結果に影響する場合があります。

このような場合、まずはプライマー設計や反応条件の見直しが基本です。
しかし、ターゲットや測定系によっては、条件検討だけでは十分な改善につながらない場合もあります。

そんなときに選択肢となるのが、プローブ法です。
タカラバイオでは、インターカレーター法で測定結果の解釈に不安があるターゲットを、プローブ法で確認したい場合に活用できるサービスとして、「PRTSS for プローブ」をご用意しています。

特異性が気になるターゲットだけ、プローブ法で確認！

すべてのターゲットをプローブ法に変更する必要はありません。
多数のターゲットはインターカレーター法で効率よく解析し、特異性が気になるターゲットについてはプローブ法の測定系で確認する、といった使い分けがおすすめです。

✔ インターカレーター法で測定しにくいターゲットに
✔ 融解曲線の結果に不安があるときに
✔ 類似遺伝子との識別を意識したいときに
✔ 重要なターゲットだけ特異性を高めて確認したいときに

プローブ法で測定するメリット

特異性を重視した発現解析が可能

プローブ法では、プライマーとプローブの両方を用いてターゲットを検出します。
そのため、インターカレーター法で非特異増幅が疑われる場合や、目的産物以外の影響をできるだけ抑えたい場合に適しています。

発現量が少ないターゲットの確認にも有用

目的以外のシグナルを抑えやすいプローブ法は、発現量が少ないターゲットを確認したい場合にも役立つことがあります。

プライマー・プローブ設計からqPCR試薬までタカラバイオが一貫してサポート

プローブ法では、ターゲットごとのプライマー・プローブ設計が重要です。
タカラバイオでは、発現解析向けのプライマー・プローブ設計・合成サービス「PRTSS for プローブ」を提供しています。さらに、qPCR試薬までタカラバイオ製品で揃えることができ、プローブ法による測定系構築をスムーズに進められます。